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多糖多酚植物種子直接PCR試劑盒

無需進行費時而昂貴的DNA純化。

樣品需求量小,只需取單粒種子即可。

無需研磨、破碎等特殊處理,操作簡便。

優化的PCR體系,使PCR具有更高的特異性、更強的PCR反應抑制物耐受性。

產 品 名 稱

多糖多酚植物種子(小型)直PCR試劑盒

Plant Seed Direct PCR Plus Kit I

貨    號

TP-03151

TP-03153

規    格

200 T

2000 T

價    格

1,617.00

13,593.00

描    述

直接使用多糖多酚種子裂解液作為模板進行PCR擴增,無需單獨抽提DNA,快速,靈敏度高,適合快速大規模基因檢測

試劑盒包含裂解液/PCR Mix


產 品 名 稱

多糖多酚植物種子(大中型)直接PCR試劑盒

Plant Seed Direct PCR Plus Kit II

貨    號

TP-03171

TP-03173

規    格

200 T

2000 T

價    格

1,942.00

15,778.00

描    述

直接使用多糖多酚種子裂解液作為模板進行PCR擴增,無需單獨抽提DNA,快速,靈敏度高,適合快速大規模基因檢測。

試劑盒包含裂解液/PCR Mix

產品介紹

本產品采用獨特的裂解反應體系,能夠快速的從多糖多酚含量高的植物種子樣本(如:香蕉、棉花等)中釋放出基因組DNA,用于PCR反應,因此特別適合大規模基因檢測。為了滿足不同檢測試驗的需要,本試劑盒可以使用多種類型的樣本(如完整種子、微量組織切塊或多顆種子的磨碎樣本)進行實驗。其中,對于還需要進行萌發的種子樣本,可以選擇切取種胚以外的微量組織切塊(1-5mg)進行實驗;對于需要在大量樣本中進行抽樣檢測的實驗,可以選擇將多個樣本混合并磨碎成直徑0.5mm左右的顆粒后再進行實驗(最低可以檢測出0.1%的目的樣本)

裂解反應體系釋放基因組DNA過程可以在5-10min內完成,不需要其他去蛋白、RNA或者次生代謝產物的過程,即可將釋放出的微量DNA作為模板進行PCR反應。

2× Seed PCR EasyTM Mix具有很強的PCR反應抑制物耐受性,能直接以植物材料的裂解混合液為模板,進行高效特異性擴增。該試劑包含公司專門針對直接PCR改造的D-Taq DNA PolymerasedNTPsMgCl2、反應緩沖液、PCR反應增強劑、優化劑和穩定劑。與裂解反應體系配合使用能夠快速簡便地對樣品進行檢測,并具有靈敏度高、特異性強、穩定性好等特點。

D-Taq DNA polymeraseForegene為直接PCR反應專門研制出的DNA polymeraseD-Taq DNA polymerase對多種PCR反應抑制劑具有極強的的耐受性、在各種復雜反應體系中均能高效擴增痕量的DNA,擴增速度可達2Kb/min,特別適合進行直接PCR反應。

根據植物樣本差異,該產品分為兩個大類:植物種子直接PCR試劑盒(Plant Seed Direct PCR Kit)和多糖多酚植物種子直接PCR試劑盒(Plant Seed Direct PCR Plus Kit)。在裂解階段,考慮到不同類型的種子或組織材料在裂解過程中試劑用量差異較大,客戶可根據自己實驗材料的大小選擇相應的植物種子(中小型)直接PCR試劑盒或植物種子(大型)直接PCR試劑盒;在PCR檢測階段,客戶也可以根據實驗需求,選用普通的2× Seed PCR EasyTM Mix或是具有防PCR擴增產物污染作用的2× Seed PCR EasyTM Mix(UNG)


試劑盒應用

用范圍:多種植物種子。

樣本裂解釋放的DNA:僅用作PCR模板。

試劑盒可用于以下用途:轉基因種子鑒定、植物基因分型等


試劑盒局限性

擴增片段≤1kb;超過1kb,擴增效率下降或者擴增失敗。

PCR產物如用于測序建議先進行PCR產物純化。

PCR產物可能會有點突變,如用于基因克隆,請知悉。

PCR產物3’末端隨機加A尾。



試劑盒內容

Buffer SSP1提供多糖多酚植物種子裂解反應所需的環境。

Buffer SSP2補充提供多糖多酚植物種子裂解反應所需的環境。

Buffer SP2中和裂解產物,使其不影響后續PCR反應。

2× Seed PCR EasyTM Mix包含福際生物特別改造的Taq DNA PolymerasedNTPsMgCl2、反應緩沖液、PCR反應增強劑、優化劑以及穩定劑等。PCR反應時,只需將適當的裂解混合液、引物、ddH2O添加到2× Leaf PCR EasyTM Mix中即可用于PCR反應。

6× DNA Loading BufferLoading Buffer中不含有SDS。建議在進行瓊脂糖凝膠電泳時,配搭使用試劑盒附贈的6× DNA Loading Buffer,以便取得好的電泳結果。切勿使用含有SDSLoading Buffer,否則在電泳時會在泳道中有一大團拖尾亮光,影響實驗結果。


儲存條件

全程低溫冰盒運輸,保證試劑盒Part IPart II處于<4狀態。

本試劑盒Part I保存在2-8

v 試劑Buffer PS1Buffer P26× DNA Loading Buffer在干燥條件下,可保存12個月;如需保存更長時間可置于2–8

本試劑盒Part II保存在-20

v  試劑Buffer PS22× Seed PCR EasyTM Mix,在-20條件下可保存12個月;若頻繁使用,也可置于4短期保存(10天內用完)


操作流程

多糖多酚種子


  • 正對照、待測樣本均無條帶

    Answer

    在試劑盒的使用過程中往往會遇到許多問題,比如:沒有PCR擴增產物、PCR特異性差等,以下就分別對使用植物種子直接PCR系列試劑盒可能會遇到的問題進行分析。建議在進行直接PCR的同時設置陽性對照或陰性對照以便后續分析實驗結果。

    1.    PCR反應體系或反應條件不合適。

    建議:使用梯度PCR摸索PCR最佳反應條件。

    2.   PCR試劑保存不當失去活性。

    建議:2× Seed PCR EasyTM Mix應保存于-20,使用時避免反復凍融。若使用頻繁,可在4短時間存放。

    3.    引物設計問題。

    建議:嘗試重新設計引物進行檢查。


  • 正對照有目的條帶,待測樣本無條帶或條帶弱

    Answer

    1.    種子中多糖多酚含量較高,裂解混合液呈棕黃色甚至棕紅色。

    建議:使用多糖多酚植物種子直接PCR試劑盒(Plant Seed Direct PCR Plus Kit)

    2.    裂解液、中和液加入比例不當,裂解混合液影響PCR體系的pH值。

    建議:正常條件下,中和后的裂解混合液的pH應該在7-8左右(普通植物種子直接PCR試劑盒,裂解產物和Buffer SP2嚴格按照1:1的量進行中和;多糖多酚植物種子直接PCR試劑盒,裂解產物和Buffer SP2嚴格按照8:5的量進行中和)

    3.    樣本裂解混合液保存不當或保存時間過久,DNA基因組已經降解。

    建議:裂解混合液可在4保存5天,盡量使用新制備的裂解液混合液進行PCR

    4.    裂解混合液中抑制物過多。

    建議:在PCR反應體系5-20%范圍內優化模板加入量。

    5.    PCR循環數不足。

    建議:適當增加PCR的循環數,推薦在35-40循環為佳。因為模板復雜,一般PCR反應要比用純化的DNA模板多5-10個循環為佳。


  • 非特異性擴增

    Answer

    1.    退火溫度偏低。

    建議:適當提高退火溫度。

    2.    PCR循環數過多。

    建議:適當降低循環次數,推薦在35-40循環為佳。

    3.    引物濃度偏高。

    建議:適量降低引物用量。通常引物終濃度為0.2μM可以得到較好結果。反應性能較差時,可以在0.1-0.5μM范圍內調整引物濃度。

    4.    PCR模板加入量過多。

    建議:配制PCR反應體系時,適量減少模板加入量。


  • 空白對照出現目的條帶

    Answer

    1.    操作工具或試劑污染。

    建議:實驗所有試劑或器材均應高壓滅菌。實驗時應規范操作,避免在加樣操作中溶液倒吸或飛濺。

    2.    樣本間交叉污染。

    建議:每個取樣器只對一個樣本使用;或取完一個樣本后,將取樣器刃口或與樣本直接接觸的部位浸入2%的次氯酸鈉溶液中,反復涮洗數次進行清洗,然后用干凈的紙巾擦干殘液后再進行使用。

    3.    PCR產物污染。

    建議:如果實驗室檢測同類型樣本多,最好使用UNGPCR產物污染系統的試劑盒進行實驗。


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