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行業聚焦:突破小核酸藥物初篩低效困局

2023-05-06 1381







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引言

introduction


2023年3月7日,阿斯利康制藥與Ionis公司的ASO類型藥物“Eplontersen”在國內申請上市,用于治療遺傳性轉甲狀腺素蛋白淀粉樣變性。該藥于2022年初由美國食品和藥物管理局(FDA)已授予孤兒藥資格(ODD)。




小核酸藥物類型及發展現狀

Types and Development Status of Small Nucleic Acid Drugs






自從1961年mRNA的發現開始,到ASO、適配體、RNAi、遞送系統,小核酸藥物一步步從想象走入現實,隱隱成為繼小分子藥物、抗體藥物外的第三大類藥物,引領新一輪的制藥浪潮。


小核酸藥物,即寡核苷酸藥物,是由十幾個到幾十個核苷酸串聯組成的短鏈核酸,作用于pre-mRNA或mRNA,通過干預靶標基因表達實現疾病治療目的。主要包括 RNAi 藥物(siRNA、miRNA)和 反義核苷酸(ASO) 藥物,另外還有核酸適配體及其他短RNA片段類型(saRNA、sgRNA、tRNA碎片等)。




Advantage

基于其靶向針對pre-mRNA或mRNA的特性,小核苷酸藥物可于RNA水平上實現對疾病的治療,可選成藥靶點更多,具有以下多重優勢:

小核酸藥物2



起初,小核酸藥物的發展瓶頸在于如何避免受體體內核酸酶的降解,成功進入細胞內部調節RNA表達水平或蛋白翻譯過程。隨著化學修飾技術的突破和GalNac遞送系統的出現,初步解決了小核酸藥物的不穩定性和缺乏有效遞送系統的問題。小核酸藥物基于疾病靶點基因序列的主動式、數字化設計、合成模式,極大地縮短了傳統藥物無法避免的篩選周期。全球相關市場規模自2016年起迅速增大,已由最初1千萬多美元增長至2022年的37.84億美元,近三年年均增長率12%以上,成為全球藥物研發領域的最前沿。



數據圖


全球小核酸藥物市場規模統計(2016-2022,單位:億美元)




小核酸藥物研發關鍵問題及挑戰

Key issues and challenges in the development of small nucleic acid drugs






小核酸藥物研發過程中的不同問題需要相應的技術加以解決。按照小核酸藥物研發流程,核心技術分為RNA設計、化學修飾、遞送、合成及制劑技術。其中最首要的核心技術在于高效準確地獲得具有效的、特異性作用分子序列;最關鍵的核心技術是小核酸藥物遞送技術,增強分子穩定性和靶向能力、降低給藥劑量和毒副作用。


在大量資本進入小核酸藥物研發行業的現狀下,鑒于靶點基因序列的多樣性與復雜性,如何快速準確篩選到具備藥效價值的核酸片段就成為研發初始的首要任務。小核酸藥物的靶向目標在于細胞內特異性RNA片段,因此對其表達水平的上調或下調存在顯著影響是藥物有效性篩選的重要指標。


對于細胞基因表達水平上調或下調的傳統研究方式,需要在給藥處理后繼續培養細胞達到一定數量級,收集細胞并純化RNA,再通過熒光定量PCR獲得CT值進行分析比較。該過程受限于RNA純化方法及通量限制,在細胞培養、核酸提取過程耗費大量時間、人力、資金,無法快速高效地獲得數據進行分析。同時由于實驗環節相對較多,數據均一性、穩定性無法達到精準化篩選要求。




Foregene

福際生物基于直接PCR/qPCR技術平臺,帶來創新性高效”5H”篩選解決方案——Cell Direct RT-qPCR kit,可于培養板原位處理細胞獲得RNA模板進行反轉錄,節省大量操作及時間,并可適配自動化,高效準確獲得細胞GOI表達水平結果,迅速確定具備藥效價值的核酸片段!


H1

H1-高效率High Efficiency:7分鐘即可完成整板RNA模板制備(5mins裂解+2mins終止),無需大型儀器。可使用多款機型的FAST擴增程序,最快可在90分鐘內完成篩選全流程,比傳統方法節約80%時間!


1圖

5min板孔原位裂解釋放RNA, 2min終止反應

所得裂解液即可作為模板進行后續RT-qPCR反應


H2

H2-高精密度High Precision:可實現全自動化操作,整板均一性好,相對傳統方法精密度數量級提升。


2圖

整板CT值均一性好


H3

H3 -高通量High Throughput:最大可一次性進行384孔基因表達篩選,相對傳統方法提升4倍以上。

細胞直接RT-qpcr圖2

藥物處理后384孔細胞基因表達差異的擴增曲線


H4

H4-高適應性High adaptability:適用于懸浮細胞與貼壁細胞擴增篩選,同時適用于超過10種常用細胞類型。試劑盒具有很低的檢測下限,10 - 106個細胞級別均能夠實現準確擴增。

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H1299細胞1E5數量級別,10倍梯度稀釋后CT值及擴增曲線

檢測位點:Actin 60


H5

H5-高準確度High Accuracy:可使用UDG防污染體系;同時RT-qPCR反應酶抑制物耐受性極強,可以無視培養基殘留干擾,讓篩選結果更可靠。


小分子藥物靶向推文圖3


RT-qPCR反應抑制物耐受性,培養基殘留干擾對比


FG

訂購信息

貨號

規格

產品名稱

DRT-01011

DRT-01012

200T

1000T

QuickEasy?

Cell Direct RT-qPCR Kit

- SYBR Green I

DRT-01021

DRT-01022

200T

1000T

QuickEasy?

Cell Direct RT-qPCR Kit

-Taqman

DRT-02121

400 T

(384-well) QuickEasy?

Cell Direct RT-qPCR Kit

- Taqman

DRT-02011

96T

(96-well) QuickEasy?

Cell Direct RT-qPCR Kit

- SYBR Green I

DRT-02021

96T

(96-well) QuickEasy?

Cell Direct RT-qPCR Kit

- Taqman




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